三元区烟草专卖局（分公司）成立于2007年1月，2021年经国务院批复、省政府发文，原梅列、三元两区合并为新的三元区，同时经国家烟草专卖局以及省烟草专卖局批复，撤销原三明市城区烟草专卖局，设立三明市三元区烟草专卖局，将三明市烟草公司城区分公司名称变更为三明市烟草公司三元分公司。三明市三元区烟草专卖局与三明市烟草公司三元分公司合署办公，负责辖区内的烟草专卖管理、卷烟营销等工作。

现三元区局（分公司）内设五办、两个市场监督管理所，在岗职工73人。辖区零售户数约1700户，年均卷烟销售1.55万箱左右，条均价130元左右，销售总量、条均价均居全市第一。